Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scaf11E9PZM7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf11E9PZM7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms