Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Chd2E9PZM4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd2E9PZM4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms