Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcdh10E9PXQ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcdh10E9PXQ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcdh10E9PXQ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms