Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hfm1D3Z4R1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hfm1D3Z4R1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hfm1D3Z4R1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms