Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms