Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3676D3Z236 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3676D3Z236 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms