Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200bD3Z0P8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem200bD3Z0P8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem200bD3Z0P8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem200bD3Z0P8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms