Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms