Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd1D3YXK1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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