Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Apol6B7ZC55 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apol6B7ZC55 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol6B7ZC55 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol6B7ZC55 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol6B7ZC55 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol6B7ZC55 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol6B7ZC55 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apol6B7ZC55 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms