Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brpf3B2KF05 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms