Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms