Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmem238A9JSM3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms