Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1jA2BFR3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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