Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sec16aA2AIX1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sec16aA2AIX1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms