Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramel3A2AHA7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel3A2AHA7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms