Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd4A2AFR3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Frmpd4A2AFR3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd4A2AFR3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms