Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2dnl2A2AFH2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms