Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb4A2A863 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms