Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf2A2A5Z6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf2A2A5Z6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms