Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms