Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms