Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Trbv21A0A0A6YX06 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Trbv21A0A0A6YX06 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Trbv21A0A0A6YX06 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Trbv21A0A0A6YX06 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trbv21A0A0A6YX06 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trbv21A0A0A6YX06 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Trbv21A0A0A6YX06 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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