Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm26992S4R1A3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm26992S4R1A3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm26992S4R1A3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm26992S4R1A3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm26992S4R1A3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm26992S4R1A3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm26992S4R1A3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26992S4R1A3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26992S4R1A3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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