Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I2

Fkbp1b, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1B, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp1bQ9Z2I2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fkbp1bQ9Z2I2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fkbp1bQ9Z2I2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fkbp1bQ9Z2I2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms