Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clic1Q9Z1Q5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clic1Q9Z1Q5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic1Q9Z1Q5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms