Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Padi4Q9Z183 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Padi4Q9Z183 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms