Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl8Q9Z121 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms