Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SncgQ9Z0F7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SncgQ9Z0F7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms