Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin2Q9WVE8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin2Q9WVE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms