Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms