Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scnn1bQ9WU38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scnn1bQ9WU38 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms