Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vax2Q9WTP9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms