Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms