Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lamc3Q9R0B6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc3Q9R0B6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc3Q9R0B6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms