Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms