Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsjQ9R014 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.9 ms