Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Map1aQ9QYR6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1aQ9QYR6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms