Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic4Q9QYB1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms