Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Foxe3Q9QY14 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Foxe3Q9QY14 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Foxe3Q9QY14 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Foxe3Q9QY14 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms