Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx8Q9QXV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx8Q9QXV1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms