Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmub1Q9JMG3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmub1Q9JMG3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmub1Q9JMG3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmub1Q9JMG3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmub1Q9JMG3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmub1Q9JMG3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmub1Q9JMG3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmub1Q9JMG3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms