Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnaja4Q9JMC3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja4Q9JMC3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms