Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep6Q9JM62 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Reep6Q9JM62 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep6Q9JM62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep6Q9JM62 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep6Q9JM62 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Reep6Q9JM62 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms