Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cul3Q9JLV5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cul3Q9JLV5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cul3Q9JLV5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms