Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Higd1aQ9JLR9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Higd1aQ9JLR9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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