Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cabp2Q9JLK4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cabp2Q9JLK4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp2Q9JLK4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms