Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nectin3Q9JLB9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms