Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg3Q9JL95 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg3Q9JL95 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms