Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx6Q9JKK1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx6Q9JKK1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms